连花清咳片的核心功效是宣肺泄热、化痰止咳，用于痰热壅肺引起的频繁咳嗽、痰多黏稠、咳痰不畅，并缓解肺热引发的咽干咽痛、胸闷心烦等伴随不适。感冒、流感、急性支气管炎、慢阻肺急性加重、新冠感染等呼吸道感染后，出现上述痰热壅肺引起的咳嗽、咳痰，也属其适用范畴。
连花清咳片的功效可拆解为“清肺、清痰、清咳”三重作用：清肺即宣肺泄热，抑菌抗病毒、抑制气道炎症、修复气道黏膜；清痰即减少痰液生成、降低痰液黏度、促进痰液排出；清咳即减轻咳嗽敏感性、降低咳嗽频率、缩短咳嗽病程。
系列临床研究显示，针对急性气管－支气管炎，连花清咳片治疗组咳嗽症状消失比例比对照组提高40.61%；针对慢阻肺急性加重，患者咳嗽、咳痰、呼吸困难等症状持续改善；针对新冠感染，应用连花清咳片组症状缓解率达98.61%，咳嗽咳痰缓解时间分别缩短3天；针对感染后咳嗽，可缩短咳嗽消失时间2天，提升咳嗽消失率22%。
基于其效果及安全性，该药已获《中医药治疗新型冠状病毒感染核酸/抗原转阴后常见症状专家共识》《全国儿童呼吸道感染中医药防治方案》《2025年北京冬季流感中医药防治方案（试行）》等30余次新冠、流感等呼吸道感染诊疗方案推荐。