连花清瘟胶囊对普通感冒、流行性感冒引发的头痛等症状，具备对症改善效果。
连花清瘟组方以麻杏石甘汤、银翘散为基础方，汲取明代吴又可治疫病用大黄经验，还创新性加入芳香化湿护脾胃的广藿香和增强免疫固正气的红景天。全方结合了清热、解毒、辛温、通腑、芳化、扶正的药物，具有清瘟解毒、宣肺泄热的功效，药效较为温和，能够有效改善感冒、流感引起的头痛、发热或高热、肌肉酸痛、鼻塞流涕、咽干咽痛等症状，且该药不含常见致嗜睡成分。
在具体疗效方面，刊登于《临床合理用药》2023年第16卷第25期的《连花清瘟胶囊治疗急性上呼吸道感染的临床效果评价》表明，连花清瘟胶囊用于感冒、流感等急性上呼吸道感染，能够有效改善头痛、发热、咳嗽、咽痛等不适，可降低机体炎性反应，调节免疫功能，促进患者症状缓解；
在《医药导报》2008年第27卷第11期发表的《连花清瘟胶囊治疗急性上呼吸道感染102例》研究结果也证实，连花清瘟胶囊治疗感冒、流感等上呼吸道感染患者疗效可靠，可改善发热、头痛等症状。
建议患者在服药期间保证休息，多饮用温水。如果头痛剧烈，伴随持续高热呕吐，需要及时就医。