普通感冒、流行性感冒后出现头疼等症状，均可以服用连花清瘟胶囊进行改善。
说明书显示，连花清瘟胶囊的功效为清瘟解毒、宣肺泄热，可治疗感冒、流感引发的头痛、发热或高热、恶寒、肌肉酸痛、鼻塞流涕、咳嗽、咽干咽痛等一系列不适症状。并且，该药为纯中药制剂，一般情况下不会引起嗜睡、困倦等不良反应。
药效学研究表明，连花清瘟具有广谱抗病毒、抑菌抗炎、调节免疫的作用，对引起普通感冒的副流感病毒、呼吸道合胞病毒、腺病毒，引发流感的甲型流感病毒(H1N1、H3N2等)、乙型流感病毒等多种病毒，以及金黄色葡萄球菌、肺炎球菌、流感杆菌等致病菌均具有抑制作用。
在治疗效果方面，《中国实验方剂学杂志》2024年第30卷发表的《肺疫证治规律探讨与连花清瘟组方新解》中的系列临床研究显示，连花清瘟方可有效治疗感冒，缓解急性上呼吸道感染患者头痛、咽喉肿痛、发热、咳嗽、鼻塞等症状，抑制炎症因子水平，调节免疫功能，提高机体免疫力。
刊登于《中国中药杂志》2017年第42卷第8期的《连花清瘟胶囊治疗流行性感冒的有效性及安全性的系统评价》研究也证实，连花清瘟胶囊治疗流行性感冒具有一定疗效，能够明显缩短头痛、咽痛、乏力等症状的持续时间。
建议患者在服药期间留意自身感受，如果头痛持续加重，或者伴随持续高热、呕吐等情况，应及时前往医院就诊检查。