普通感冒、流行性感冒引发的头痛、鼻塞等症状，均属于连花清瘟胶囊的适用范畴。
连花清瘟胶囊拥有清瘟解毒、宣肺泄热的功效，组方融合麻杏石甘汤、银翘散两大经典古方，配伍广藿香以芳香化湿护脾胃，红景天则能够固护人体正气、调节人体免疫力。整个组方结合了清热、解毒、辛温、通腑、芳化、扶正的药物，药效较为温和，能够有效缩短病程、促进人体康复，针对多种呼吸道疾病引发的头痛、鼻塞、发热、恶寒、肌肉酸痛等“外感病”症候群，可对症治疗。
药效学研究也显示，连花清瘟胶囊组方中的多种活性成分能够协同作用，具有广谱抗病毒，抑菌抗炎，退热、止咳、化痰，调节免疫等作用，能够有效缓解普通感冒、流行性感冒引起的头痛、鼻塞等症状。
此外，刊登于《临床合理用药》2023年第16卷的《连花清瘟胶囊治疗急性上呼吸道感染的临床效果评价》等研究结果进一步表明，连花清瘟胶囊用于感冒、流感等急性上呼吸道感染，可有效改善鼻塞、头痛等不适，降低机体炎性反应，促进患者症状缓解。
刊登于《中国中药杂志》2017年第42卷第8期的《连花清瘟胶囊治疗流行性感冒的有效性及安全性的系统评价》也证实，连花清瘟可以缩短流感患者头痛、鼻塞、咽痛、乏力等症状的持续时间。并且，用药后一般不会引发嗜睡、困倦等不良反应。