连花清瘟胶囊具有清瘟解毒、宣肺泄热的功效，对于感冒、流感引发的嗓子红肿、疼痛均能够起到缓解作用。
连花清瘟胶囊的组方当中含有连翘、金银花、板蓝根、鱼腥草、甘草等多味清热解毒药材，搭配薄荷脑，既能清解体内热毒，还可以给咽部带来清凉感受，减轻咽喉部位红肿不适感，整体药效较为温和，能够有效缩短病程、促进人体康复，且服用后一般不会出现嗜睡、困倦。
在治疗效果方面，刊登于《中国实验方剂学杂志》2024年第30卷第17期的《肺疫证治规律探讨与连花清瘟组方新解》系列临床研究显示，连花清瘟方可改善急性上呼吸道感染患者咽喉肿痛红肿等表现，抑制炎症因子，调节免疫功能，提高机体免疫力。
刊登于《中国中药杂志》2017年第42卷第8期的《连花清瘟胶囊治疗流行性感冒的有效性及安全性的系统评价》同样表明，连花清瘟胶囊可以缩短流感患者咽痛红肿等症状的持续时间，且安全性较高。另外，建议在服药期间多饮用温水，忌辛辣刺激食物，辅助咽喉恢复。