连花清瘟胶囊可以缓解感冒、流感引发的多种不适症状，具体包括发热、恶寒、肌肉酸痛、鼻塞流涕、咳嗽、头痛、咽干咽痛等。
连花清瘟胶囊全方以银翘散、麻杏石甘汤为基础方加减化裁，汲取明代吴又可治疫病用大黄经验，再结合肺疫病变特点，创新加入红景天调节免疫固正气、广藿香芳香化湿护脾胃，具有“清热与辛温兼备、解毒与芳化并用、扶正与通腑同施”组方特色，能够清瘟解毒、宣肺泄热，有效改善感冒、流感引起的多种不适症状。
刊登于《临床合理用药》2023年第16卷的《连花清瘟胶囊治疗急性上呼吸道感染的临床效果及对临床症状缓解时间和炎性指标的影响》研究显示，连花清瘟胶囊治疗感冒、流感等急性上呼吸道感染疗效较好，可降低机体炎性反应，调节免疫功能，促进患者症状缓解，且用药安全性高，用药后一般不会引起嗜睡、困倦，不影响正常生活。
在《中国实验方剂学杂志》2024年第30卷发表的《肺疫证治规律探讨与连花清瘟组方新解》中的系列临床研究也证实，连花清瘟方可有效治疗感冒，能够缓解急性上呼吸道感染患者咽喉肿痛、发热、咳嗽、鼻塞等症状，抑制炎症因子水平，调节免疫功能，提高机体免疫力。
此外，连花清瘟胶囊还先后36次被列入防治甲流、乙流等呼吸系统传染病的诊疗方案或指南共识，并多次获评“中国家庭常备药（感冒药）上榜品牌”、“北京晚报读者推荐家庭常备感冒药”。