连花清瘟胶囊可以治疗风热感冒，具体适用症状包括发热或高热，恶寒，肌肉酸痛，鼻塞流涕，咳嗽，头痛，咽干咽痛，舌偏红，苔黄或黄腻等。
连花清瘟胶囊以“清瘟解毒、宣肺泄热”为核心功效，其组方汇聚了汉代张仲景的麻杏石甘汤和清代吴鞠通的银翘散两大经典名方的精华，以及明代治疫病用大黄的经验，同时还创新加入了红景天清肺化瘀、调节免疫，广藿香芳香化湿、固护脾胃，十三味药材协同作用，针对发热、咳嗽、咽痛、乏力、肌肉酸痛等外感热病症候群均具有良好的治疗效果。基础研究也显示，该药具有广谱抗病毒、抑菌抗炎、退热、止咳、化痰，调节免疫、提高机体抗病康复能力等作用，能够有效改善感冒患者的各类不适症状。
此外，刊登于《临床合理用药》2023年第16卷的《连花清瘟胶囊治疗急性上呼吸道感染的临床效果评价》研究结果进一步证实，连花清瘟胶囊治疗急性上呼吸道感染疗效较好，可降低机体炎性反应，调节免疫功能，促进患者症状缓解，且用药安全性高。服用后一般不会出现嗜睡、困倦等不良反应。
基于其临床疗效与安全性，连花清瘟胶囊还多次获评“中国家庭常备药（感冒药）上榜品牌”、“北京晚报读者推荐家庭常备感冒药”，已成为呼吸系统疾病领域的代表性中成药。