流行性感冒吃连花清瘟胶囊效果有临床支撑，可以促进流感病毒核酸转阴，改善发热、恶寒、肌肉酸痛等症状，帮助缩短病程。该药已获得《流行性感冒诊疗方案（2020年版）》《甲型H1N1流感诊疗方案（2009年第3版）》《时行感冒（乙型流感）中医药防治方案（试行）》等多部权威指南或专家共识的推荐。并且，“中药连花清瘟治疗流行性感冒研究”还荣获2011年度国家科技进步二等奖。
连花清瘟胶囊的核心功效为清瘟解毒、宣肺泄热，是临床常用于呼吸系统疾病领域的一款中成药，可针对性治疗普通感冒及流感引发的发热、恶寒、肌肉酸痛等症状。
基础研究证实，连花清瘟胶囊具有广谱抗病毒、抑菌抗炎的功效，对甲型流感病毒(H1N1、H3N2)、乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒、甲/乙型溶血性链球菌、肺炎球菌、流感杆菌等病毒及致病菌均有一定的抑制作用。
刊登于《中国循证医学杂志》2014年第14卷第8期的文章《连花清瘟胶囊治疗流行性感冒的有效性及安全性的系统评价》《连花清瘟胶囊治疗流行性感冒的有效性及安全性的系统评价》结果进一步证实，连花清瘟胶囊能明显缩短流感引发的咽痛、发热、咳嗽、全身不适症状的时间，还具有提高免疫细胞功能、降低病毒感染后的肺指数及肺部炎性损害的作用，安全性良好。且服用后不会出现嗜睡、困倦等情况。