连花清瘟胶囊可以起到清热解毒的作用。连花清瘟胶囊功效为清瘟解毒、宣肺泄热，临床常用于治疗感冒、流感引起的发热或高热，恶寒，肌肉酸痛，鼻塞流涕，咳嗽，头痛，咽干咽痛等症状。
从其组方来看，连花清瘟胶囊全方以银翘散、麻杏石甘汤为基础方加减化裁，汲取明代吴又可治疫病用大黄经验，还创新性加入芳香化湿护脾胃的广藿香和增强免疫固正气的红景天。整方既有清热解毒、针对病毒发挥积极作用的药物，又有芳香化湿护脾胃、提高免疫固正气的药物，针对多种呼吸道疾病引发的发热、恶寒、肌肉酸痛等“外感病”症候群，都能对症治疗。并且，该药为纯中药制剂，服用后无嗜睡、困倦等不良反应。
基础研究也进一步证实，连花清瘟组方中的多种活性成分能够协同作用，系统干预病毒性呼吸系统传染性疾病，具有广谱抗病毒、抑菌抗炎、退热、止咳、调节机体免疫等多种药理作用。
感冒或流感患者在服药期间应忌烟酒、辛辣生冷食物，多饮温水，保证休息，有助于促进免疫系统恢复，缩短病程。