甲流患者规范服用连花清瘟胶囊，可有效缓解甲流引发的发热、恶寒、肌肉酸痛、头痛、咽痛、咳嗽、鼻塞流涕等症状。
基础研究证实，连花清瘟对引起流感的甲型流感病毒（H1N1、H3N2）、乙型流感病毒有抑制作用。国家重点实验室研究证实连花清瘟多环节抗甲型H3N2流感病毒：具体表现为综合抑制作用、对病毒吸附的预防作用、抑制病毒吸附后的复制增殖作用以及直接杀伤病毒的作用。
《连花清瘟胶囊治疗甲型H1N1流感的临床研究》结果证实，连花清瘟胶囊治疗流感疗效较好，可有效缓解发热、咳嗽、头痛、乏力、肌肉酸痛等流感症状。并且，该药能缩短流感病毒核酸转阴时间，减轻疾病严重程度，缩短病程。且连花清瘟为纯中药制剂，无嗜睡、困倦等不良反应。
截至目前，连花清瘟胶囊已先后36次被列入防治甲流、乙流等呼吸系统传染病的诊疗方案或指南共识。并且，“中药连花清瘟治疗流行性感冒研究”还曾获得2011年度国家科技进步二等奖。这些都是对连花清瘟胶囊有效性、安全性方面的认可。
用药时需注意，如果持续高热不退、出现呼吸困难或胸闷，应及时就医。服药期间多饮温水、保证休息，做好防护避免传染他人。