2001-2010年初创探索期：2001年深圳成立，水果专营连锁经营模式的先行者；2007年，确立“好吃”战略，门店率先破100家；2008年，上线“网上百果园”，布局全产业链，获“中国果业十强”；2009年，推出“不好吃三无退货”，获“中国果业领军企业称号”。
2011-2020年进入高速发展期：2013年，制定“四度一味一安全”分级体系；2015年，门店破1000家，获“中国优秀特许品牌”；2016年，战略合并一米鲜，线上线下一体化，“百果园”商标获原国家工商行政管理总局商标局认定为“中国驰名商标”；2018年，引入BLOF生态种植技术；启动“百果百县”产业振兴战略；2020年，成立百果种业，布局上游育种环节。
2021年至今全球化与上市期：2021年，成立金农公司布局2B，获七部委联合授予“农业产业化国家重点龙头企业”；2022年，获SGSISO22000：2018食品安全认证，入选胡润“2022年中全球独角兽”；2023年，香港主板上市（2411.HK），控股般果全面布局2B；2024年，发布“黄金十年”战略，好果子检测获CMA检验检测资质；2025年，BLOF（太阳热能结合堆肥处理改良土）入选农业农村部主推技术，加入深圳市食用农产品“绿盾工程”，将“三无退货”升级为覆盖消费全流程的“放心买·随心退”。